Zuckerman Institute

2025

An emerging view of neural geometry in motor cortex supports high-performance decoding

Perkins, S. M., Amematsro, E. A., Cunningham, J., Wang, Q. & Churchland, M. M., feb. 3 2025, En: eLife. 12

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Acceso abierto

DREDge: robust motion correction for high-density extracellular recordings across species

Windolf, C., Yu, H., Paulk, A. C., Meszéna, D., Muñoz, W., Boussard, J., Hardstone, R., Caprara, I., Jamali, M., Kfir, Y., Xu, D., Chung, J. E., Sellers, K. K., Ye, Z., Shaker, J., Lebedeva, A., Raghavan, R. T., Trautmann, E., Melin, M. & Couto, J. y 20 otros, Garcia, S., Coughlin, B., Elmaleh, M., Christianson, D., Greenlee, J. D. W., Horváth, C., Fiáth, R., Ulbert, I., Long, M. A., Movshon, J. A., Shadlen, M. N., Churchland, M. M., Churchland, A. K., Steinmetz, N. A., Chang, E. F., Schweitzer, J. S., Williams, Z. M., Cash, S. S., Paninski, L. & Varol, E., 2025, (Accepted/In press) En: Nature Methods. 2344.

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Acceso abierto

StyleTTS: A Style-Based Generative Model for Natural and Diverse Text-to-Speech Synthesis

Li, Y. A., Han, C. & Mesgarani, N., 2025, (Accepted/In press) En: IEEE Journal on Selected Topics in Signal Processing.

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Understanding the neural code of stress to control anhedonia

Xia, F., Fascianelli, V., Vishwakarma, N., Ghinger, F. G., Kwon, A., Gergues, M. M., Lalani, L. K., Fusi, S. & Kheirbek, M. A., ene. 16 2025, En: Nature. 637, 8046, p. 654-662 9 p., 2419.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

2024

Abstract representations emerge in human hippocampal neurons during inference

Courellis, H. S., Minxha, J., Cardenas, A. R., Kimmel, D. L., Reed, C. M., Valiante, T. A., Salzman, C. D., Mamelak, A. N., Fusi, S. & Rutishauser, U., ago. 22 2024, En: Nature. 632, 8026, p. 841-849 9 p.

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Acceso abierto

5 Citas (Scopus)

A mathematical theory of relational generalization in transitive inference

Lippl, S., Kay, K., Jensen, G., Ferrera, V. P. & Abbott, L. F., jul. 9 2024, En: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 121, 28, e2314511121.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

A Method for Treating Significant Conformational Changes in Alchemical Free Energy Simulations of Protein-Ligand Binding

Liao, J., Sergeeva, A. P., Harder, E. D., Wang, L., Sampson, J. M., Honig, B. & Friesner, R. A., 2024, (Accepted/In press) En: Journal of Chemical Theory and Computation.

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1 Cita (Scopus)

Emergent neural dynamics and geometry for generalization in a transitive inference task

Kay, K., Biderman, N., Khajeh, R., Beiran, M., Cueva, C. J., Shohamy, D., Jensen, G., Wei, X. X., Ferrera, V. P. & Abbott, L. F., abr. 2024, En: PLoS Computational Biology. 20, 4 April, e1011954.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

HCN1 hyperpolarization-activated cyclic nucleotide–gated channels enhance evoked GABA release from parvalbumin-positive interneurons

Buss, E. W., Lofaro, O. M., Barnett, A., Leroy, F., Santoro, B., Siegelbaum, S. A. & Bock, T., oct. 15 2024, En: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 121, 42, e2319246121.

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

Hue selectivity from recurrent circuitry in Drosophila

Christenson, M. P., Sanz Diez, A., Heath, S. L., Saavedra-Weisenhaus, M., Adachi, A., Nern, A., Abbott, L. F. & Behnia, R., jun. 2024, En: Nature Neuroscience. 27, 6, p. 1137-1147 11 p.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

Network-based elucidation of colon cancer drug resistance mechanisms by phosphoproteomic time-series analysis

Rosenberger, G., Li, W., Turunen, M., He, J., Subramaniam, P. S., Pampou, S., Griffin, A. T., Karan, C., Kerwin, P., Murray, D., Honig, B., Liu, Y. & Califano, A., dic. 2024, En: Nature Communications. 15, 1, 3909.

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Acceso abierto

3 Citas (Scopus)

Vivien Chevaleyre (1973-2024)

Castillo, P. E., Desarménien, M. G. & Siegelbaum, S. A., may. 1 2024, En: Neuron. 112, 9, p. 1387-1389 3 p.

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ZEPPI: Proteome-scale sequence-based evaluation of protein–protein interaction models

Zhao, H., Petrey, D., Murray, D. & Honig, B., may. 21 2024, En: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 121, 21, e2400260121.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

2020

Expectation propagation as a way of life: A framework for Bayesian inference on partitioned data

Vehtari, A., Gelman, A., Sivula, T., Jylänki, P., Tran, D., Sahai, S., Blomstedt, P., Cunningham, J. P., Schiminovich, D. & Robert, C. P., ene. 1 2020, En: Journal of Machine Learning Research. 21

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44 Citas (Scopus)

2018

New Drugs from Old

Gogos, J., sep. 18 2018, En: Scientific American. 319, 4, p. 10 1 p.

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1 Cita (Scopus)

2017

The critical role of nonhuman primates in medical research

Friedman, H., Ator, N., Haigwood, N., Newsome, W., Allan, J. S., Golos, T. G., Kordower, J. H., Shade, R. E., Goldberg, M. E., Bailey, M. R. & Bianchi, P., 2017, En: Pathogens and Immunity. 2, 3, p. 352-365 14 p.

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Acceso abierto

72 Citas (Scopus)

2016

Motivated cognition: Neural and computational mechanisms of curiosity, attention, and intrinsic motivation

Gottlieb, J., Lopes, M. & Oudeyer, P. Y., 2016, En: Advances in Motivation and Achievement. 19, p. 149-172 24 p.

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Acceso abierto

30 Citas (Scopus)

2014

A Conversation with Daniel Wolpert

Wolpert, D. & Witkowski, J., 2014, En: Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 79, p. 297-298 2 p.

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

A Conversation with Michael Shadlen

Shadlen, M. & Goldstein, A., 2014, En: Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 79, p. 291-292 2 p.

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Acceso abierto

A Conversation with Richard Axel

Axel, R. & Carniol, K., 2014, En: Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 79, p. 258-259 2 p.

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Acceso abierto

CgChIP: A cell type-and gene-specific method for chromatin analysis

Agelopoulos, M., McKay, D. J. & Mann, R. S., 2014, En: Methods in Molecular Biology. 1196, p. 291-306 16 p.

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3 Citas (Scopus)

SELEX-seq: A method for characterizing the complete repertoire of binding site preferences for transcription factor complexes

Riley, T. R., Slattery, M., Abe, N., Rastogi, C., Liu, D., Mann, R. S. & Bussemaker, H. J., 2014, En: Methods in Molecular Biology. 1196, p. 255-278 24 p.

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Acceso abierto

61 Citas (Scopus)

2013

In vivo two-photon imaging of experience-dependent molecular changes in cortical neurons.

Cao, V. Y., Ye, Y., Mastwal, S. S., Lovinger, D. M., Costa, R. M. & Wang, K. H., 2013, En: Unknown Journal. 71

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16 Citas (Scopus)

2012

Biology and the future of psychoanalysis: A new intellectual framework for psychiatry revisited

Kandel, E. R., 2012, En: Psychoanalytic Review. 99, 4, p. 607-644 38 p.

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Acceso abierto

14 Citas (Scopus)

The biological mind and art. A conversation with Eric Kandel, MD. Interview by Sue Pondrom.

Kandel, E., nov. 2012, En: Annals of Neurology. 72, 5, p. A7-8

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2 Citas (Scopus)

2011

Analysis of dendrite development in Drosophila embryos

Shrestha, B. R. & Grueber, W. B., ago. 2011, En: Cold Spring Harbor Protocols. 6, 8, p. 967-972 6 p.

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2 Citas (Scopus)

Generation and staining of MARCM clones in Drosophila

Shrestha, B. R. & Grueber, W. B., ago. 2011, En: Cold Spring Harbor Protocols. 6, 8, p. 973-979 7 p.

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8 Citas (Scopus)

Imaging action potentials with calcium indicators

Yuste, R., MacLean, J., Vogelstein, J. & Paninski, L., ago. 2011, En: Cold Spring Harbor Protocols. 6, 8, p. 985-989 5 p.

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Acceso abierto

24 Citas (Scopus)

Methods for exploring the genetic control of sensory neuron dendrite morphogenesis in Drosophila

Shrestha, B. R. & Grueber, W. B., ago. 2011, En: Cold Spring Harbor Protocols. 6, 8, p. 910-916 7 p.

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Acceso abierto

3 Citas (Scopus)

2010

A generalized linear model of the impact of direct and indirect inputs to the lateral geniculate nucleus.

Babadi, B., Casti, A., Xiao, Y., Kaplan, E. & Paninski, L., 2010, En: Journal of Vision. 10, 10, p. 22 1 p.

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Acceso abierto

27 Citas (Scopus)

2009

Integrative encoding

Shohamy, D. & Wagner, A. D., mar. 2009, En: American Journal of Psychiatry. 166, 3, p. 284 1 p.

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3 Citas (Scopus)

2006

Biology of the mind.

Kandel, E., mar. 27 2006, En: Newsweek. 147, 13, p. 47 1 p.

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4 Citas (Scopus)

Models and properties of power-law adaptation in neural systems

Drew, P. J. & Abbott, L. F., 2006, En: Journal of Neurophysiology. 96, 2, p. 826-833 8 p.

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118 Citas (Scopus)

2005

Effects of electrical microstimulation in monkey frontal eye field on saccades to remembered targets

Opris, I., Barborica, A. & Ferrera, V. P., dic. 2005, En: Vision Research. 45, 27, p. 3414-3429 16 p.

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Acceso abierto

23 Citas (Scopus)

Evidence for sensory prediction deficits in schizophrenia

Shergill, S. S., Samson, G., Bays, P. M., Frith, C. D. & Wolpert, D. M., dic. 2005, En: American Journal of Psychiatry. 162, 12, p. 2384-2386 3 p.

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341 Citas (Scopus)

Identification of a transiently exposed VE-cadherin epitope that allows for specific targeting of an antibody to the tumor neovasculature

May, C., Doody, J. R., Abdullah, R., Balderes, P., Xu, X., Chien, P. C., Zhu, Z., Shapiro, L., Kussie, P., Hicklin, D. J., Liao, F. & Bohlen, P., jun. 1 2005, En: Blood. 105, 11, p. 4337-4344 8 p.

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Acceso abierto

83 Citas (Scopus)

Prediction of multimolecular assemblies by multiple docking

Inbar, Y., Benyamini, H., Nussinov, R., Wolfson, H. J. & Honig, B., jun. 3 2005, En: Journal of Molecular Biology. 349, 2, p. 435-447 13 p.

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76 Citas (Scopus)

2003

Dissociating hippocampal versus basal ganglia contributions to learning and transfer

Myers, C. E., Shohamy, D., Gluck, M. A., Grossman, S., Kluger, A., Ferris, S., Golomb, J., Schnirman, G. & Schwartz, R., feb. 15 2003, En: Journal of Cognitive Neuroscience. 15, 2, p. 185-193 9 p.

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180 Citas (Scopus)

Is depth perception of stereo plaids predicted by intersection of constraints, vector average or second-order features?

Delicato, L. S. & Qian, N., 2003, En: Journal of Vision. 3, 9, p. 97a

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

Saccadic behavior in Rhesus monkeys performing a visual search task

Ipata, A., Krishna, B. S., Bisley, J. W., Gottlieb, J. & Goldberg, M., 2003, En: Journal of Vision. 3, 9, p. 622a

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Acceso abierto

The oblique effect depends on the perceived, rather than physical, orientation and direction

Meng, X. & Qian, N., 2003, En: Journal of Vision. 3, 9, p. 761a

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

2001

Biology and the future of psychoanalysis: A new intellectual framework for psychiatry revisited

Kandel, E. R., 2001, En: Economics of Neuroscience. 3, 2, p. 53-65 13 p.

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Nobel laureates' letter to President Bush.

Arrow, K. J., Axelrod, J., Benacerraf, B., Berg, P., Bishop, J. M., Bloembergen, N., Brown, H. C., Cibelli, J., Cohen, S., Cooper, L. N., Corey, E. J., Cronin, J. W., Curl, R., Dulbecco, R., Fischer, E. H., Fitch, V. L., Fogel, R., Friedman, J. I., Furchgott, R. F. & Gell-Mann, M. y 62 otros, Gilbert, W., Gilman, A., Glaser, D., Glashow, S. L., Green, R. M., Greengard, P., Guillemin, R., Hayflick, L., Hauptman, H. A., Heckman, J. J., Heeger, A., Herschbach, D., Hubel, D. H., Hulse, R., Kandel, E., Karle, J., Klein, L. R., Kohn, W., Kornberg, A., Krebs, E. G., Lanza, R. P., Laughlin, R., Lederman, L., Lee, D. M., Lewis, E., Lipscomb, W., Marcus, R. A., McFadden, D., Merrifield, R. B., Merton, R., Modigliani, F., Molina, M. J., Murad, F., Nirenberg, M. W., North, D. C., Olah, G. A., Osheroff, D., Palade, G. E., Perl, M., Ramsey, N. F., Richter, B., Roberts, R. J., Samuelson, P. A., Schwartz, M., Sharp, P. A., Smalley, R. E., Smith, H. O., Solow, R. M., Stormer, H., Taube, H., Taylor, R., Thomas, E. D., Tobin, J., Tonegawa, S., Townes, C., Watson, J. D., Weinberg, S., Weller, T. H., West, M. D., Wieschaus, E. F., Wiesel, T. N. & Wilson, R. W., feb. 22 2001, En: Washington post (Washington, D.C. : 1974). p. A02

Producción científica › revisión exhaustiva

1 Cita (Scopus)

Presenilin-mediated transmembrane cleavage is required for Notch signal transduction in Drosophila

Struhl, G. & Greenwald, I., ene. 2 2001, En: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 98, 1, p. 229-234 6 p.

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127 Citas (Scopus)

Psychotherapy and the single synapse: the impact of psychiatric thought on neurobiological research. 1979.

Kandel, E. R., mar. 2001, En: Journal of Neuropsychiatry and Clinical Neurosciences. 13, 2, p. 290-300; dscussion 289

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26 Citas (Scopus)

2000

Expressive genes record memories

Lees, G. V., Jones, E. G. & Kandel, E., 2000, En: Neurobiology of Disease. 7, 5, p. 533-536 4 p.

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5 Citas (Scopus)

1999

Biology and the future of psychoanalysis: A new intellectual framework for psychiatry revisited

Kandel, E. R., abr. 1999, En: American Journal of Psychiatry. 156, 4, p. 505-524 20 p.

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725 Citas (Scopus)

Conservation of sequence and structure flanking the mouse and human β-globin loci: The β-globin genes are embedded within an array of odorant receptor genes

Bulger, M., Von Doorninck, J. H., Saitoh, N., Telling, A., Farrell, C., Bender, M. A., Felsenfeld, G., Axel, R. & Groudine, M., dic. 1999, En: Chemtracts. 12, 13, p. 949-955 7 p.

Producción científica › revisión exhaustiva

Spatio-temporal prediction modulates the perception of self-produced stimuli

Blakemore, S. J., Frith, C. D. & Wolpert, D. M., 1999, En: Journal of Cognitive Neuroscience. 11, 5, p. 551-559 9 p.

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Acceso abierto

656 Citas (Scopus)

1998

Relationship between dishabituation, sensitization, and inhibition of the gill- and siphon- withdrawal reflex in Aplysia californica: Effects of response measure, test time and training stimulus

Hawkins, R. D., Cohen, T. E., Greene, W. & Kandel, E. R., 1998, En: Behavioral Neuroscience. 112, 1, p. 24-38 15 p.

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28 Citas (Scopus)

Zuckerman Institute

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